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首个新冠病毒刺突蛋白全原子开源模型问世

2020-06-24 00:00 来源:科技日报

  刺突蛋白在新冠病毒进入人体细胞中起关键作用,使其成为新冠肺炎疫苗和抗病毒药物开发的主要靶标。据物理学家组织网22日报道,一个国际科研团队近日创建了首个刺突蛋白全原子开源模型,研究人员称,科学家们可利用最新模型,针对新冠肺炎防治方法开展富有创新性的模拟研究,从而促进疗法和疫苗的研发进度。

  来自韩国国立大学、英国剑桥大学和美国理海大学的研究人员携手开发了最新模型。研究发表于最新一期《物理化学B杂志》。

  刺突蛋白是新冠病毒用来与受体结合的主要表面蛋白,当刺突蛋白与人类细胞受体结合后,病毒膜与人类细胞膜融合,使得病毒基因组得以进入人类细胞并开始感染。

  研究人员用冷冻电镜测定了刺突蛋白的结构,但这一模型有许多丢失的氨基酸残基。因此,他们首先对缺失的残基进行建模,然后对其他缺失的域进行建模。此外,他们也对附着于刺突蛋白的所有潜在聚糖(或碳水化合物)进行了建模。这些聚糖会阻止抗体识别出刺突蛋白,加大疫苗研发的难度。他们还创建出了刺突蛋白的病毒膜系统,用于分子动力学模拟。

  里海大学生物科学和生物工程学系教授尹元弼(音)说:“我们的模型是首个完全糖基化、全链新冠病毒刺突蛋白开源模型,科学家可以使用我们的模型,针对新冠肺炎防治方法开展富有创新性的模拟研究。”

(责任编辑:王蔚)

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